Тем что под ОС берут отдельные (иногда шустрые) диски, но небольшого объема и система живет только там в 1 рейде. А диски под массив - юзаются под массив, никак не мешаются с системой и в случае выхода из строя какого либо из дисков не нагнут всю систему.