В ситуациях когда код работа с доменом разделена на команды и запросы, и вот команды они про богатую модель , доктрину агрегаты, сущности, объекты значения, а вот запросы - про то что бы максимально быстро и эффективно выгрести данные из бд и сразу их намапить на dto ответа - подход когда в колонке хранится массив id - затруднит построение нативных sql запросов.