Это долгая песня, что б обьяснить тебе как это работает, суть в том, что в том коде который я скинул ты будто бы говоришь, “Сцена (это то что отображает твою аппку) покажи мне на весь экран мой mainVC). Ну +- короче. Я ж говорю долгая песня, не все сразу.
Тебе в любом случае что б показать начальный экран надо писать в willConnectTo теперь этот метод отвечает за это. AppDelegate теперь отвечает за запуск аппки, дальше выполняет все Scene. Так что обращай на это внимание когда смотришь видосы старые.
Во вторых тебе не обязательно там юзать только навигейшн, скорее всго можно и UIViewController, но я с ним там еще не делал. А щас тестить нету времени.