Если при старте «1С:Предприятия» ваше расширение успешно применилось к конфигурации, это еще не гарантия того, что все расширяющие методы, которые находятся в расширении, будут выполняться. Это связано с безопасностью.
Если же прикладное решение работает в файловом варианте (как в нашем случае) или в клиент-серверном варианте без профилей безопасности, то при применении расширения в безопасном режиме исполнения встроенного языка будут расширяться только клиентские методы и серверные обработчики форм, которые установлены через панель свойств. К остальным серверным методам (в т. ч. и к аннотированным серверным методам модулей) расширение применяться не будет.
Именно то что вы написали в статье и написано
https://its.1c.ru/db/pubextensions/content/58/hdoc