Не знаю что за разовые заполнения, но когда у тебя фичи на проде пользователями тестируются, без подключаемых отчетов и обработок сильно не разгуляешься
А чтоб не попадать впросак при рефакторинге я их выгружаю в каталог и глобальный поиск конфигуратора натравливаю на него, чтоб шерстил и подключаемый код