Если меняется версия конфигурации или библиотеки, то обновление вспомогательных данных запускается автоматически и ничего вручную запускать не нужно.
Если ты поменял что-то в метаданных, но версию конфигурации не поменял, запускаешь эту обработку вручную.
Если ты поменял что-то в метаданных, но версию конфигурации не поменял, запускаешь эту обработку вручную - интересует автоматизация этого варианта. Хотя предполагаю, что не в том направлении думаю