Но вот нагрузка выросла. Так при старте только 1с один пользователь на 2-3 мируты может загрузить процессор на 7%. Причем виртуальная машина имеет 20 ядер.
Потому, что 1 с 7.7 официально не поддерживает 2016.
Причины могут быть самые глубинные - внутренний код просто не учитывает/не использует возможнсти новой ОС/железа. Или использует их неправильно.
То что у вас завелось, не значит что должно работать так, как вы ожидаете.
Так что либо закопайте стюардессу, либо запустите виртуалку с 2008р2 сервером, например, либо ебите программистов и очень хорошего аутсерсера.