С другой стороны, тонкий диск имеет бОльший оверхед при операциях записи, так как помимо file allocation table создаётся ещё и block allocation table. Для нагруженных по записи приложений это может быть критично.
Но это опять же зависит от того, откуда взят датастор. Если это понтовый сторадж, то, вероятно, этим можно пренебречь.