он имеет ввиду, что JAR-ник сможет запустить любая домохозяйка и ввести данные подключения к БД в браузере. Домохозяйка может и не уметь сеттить энвайронмент вариаблы.
довольно распространенный подход во всяких пхп-тулхаз, я скажу.. при первом запуске тулза смотрит свой конфиг, видит, что там нет данных подключения, показывает примерно вот такой мастер, как на скриншоте, затем на последнем шаге все внесенные данные записывает в свой конфиг и при следующих "запусках" использует. При этом, под "запусками" тут подразумевается любое открытие любой страницы, т.к. это ПХП и там инициализация происходит при каждом запросе.
в java действительно не встречал такого подхода..