В винде по-моему обычный диспетчер задач не показывает треды создаваемые процессом, поставьте сторонее приложение (например Process Explorer), чтобы убедиться в том, что сборщики шалят
Запишите TID наиболее прожорливых тредов и с помощью jstack например (много вариантов тут) сделайте тред дамп. Там будут эти TID, будет понятно что за треды, если формат числа может быть шестандцатиричный, надо конвертировать
помогите расшифровать) Я нашел эти потоки только по nid а не tid в дампах
какой-то странное стечение обстоятельств, было несколько подобных проблем именно на винде говорят переключение томката с NIO на NIO2 помогает в этом случае