ну вот например в hibernate session.persist(object), а спринг выдает ошибку, как объект следует сохранить в спринге?

через EntityManager

пожалуй, важнее разобраться в обоих инструментах прежде чем начинать кодить, не?

вот и разбираюсь

Репозитории в спринг дате это лишь более высокая абстракция, основной интерфейс JPA - EntityManager, либо проприетарный хибернейтовский можно использовать

spring boot получается как следующий уровень абстракции

Написал простеньеий запрос:

public BorderoProcedureResponse executeBorderoGenerationProcedure() {
  SimpleJdbcCall jdbcCall = new SimpleJdbcCall(this.jdbcTemplate)
      .withSchemaName("bordero")
      .withProcedureName("simple");
  Map<String, Object> out = jdbcCall.execute();
  return null;
}

Написал простенькую процедуру:

CREATE OR REPLACE PROCEDURE bordero.simple()
LANGUAGE plpgsql    
AS $$
BEGIN
END;
$$;

Но что-то все равно не работает:

Caused by: org.springframework.jdbc.BadSqlGrammarException: CallableStatementCallback; bad SQL grammar [{call bordero.simple()}]; nested exception is org.postgresql.util.PSQLException: ERROR: bordero.simple() is a procedure
  Hint: To call a procedure, use CALL.
  Position: 15

Используй statement с вызовом CALL, примерно вот так: https://github.com/pgjdbc/pgjdbc/pull/1276/files#diff-5d20e7e74100b201c5ddf4be92e48045R77

да, так рабоатет, спасибо. а не знаешь почему тот метод не рабоатет?

особенности архитектуры постгреса.

у меня есть репозиторий, сущность (entity), и в контроллер я прописываю autowired репо. но теперь я понял что все записи из БД помещаются в репо и это плохо, как быть?

Что значит "все помещаются в репо"?

создаются связанные объекты

Какие ещё связанные объекты? Где создаются?

но мне репо нужен был лишь для добавления новых объектов

ну в репо помещаются экземпляры entity из БД

и как вы это поняли?

репозиторий не содержит магии, можешь открыть исходник и увидеть как конкретно он использует EntityManager
https://github.com/spring-projects/spring-data-jpa/blob/master/src/main/java/org/springframework/data/jpa/repository/support/SimpleJpaRepository.java

Ничего никуда не помещается, с чего ты это взял?