Главные косяки текущей версии комментариев — проблема модерации и мешанина в группе.
Но зачем было реализовывать комментарии к постам, как ветки обсуждений в группе?

Технически комментарии являются сообщениями. Для хранения сообщений необходим какой-то чат. А раз чаты-обсуждения для каналов уже есть, зачем усложнять архитектуру каналов функциями групп (сюда же нужно будет добавлять модерацию и т.д.)? Также это логично и для обратной совместимости, чтобы пользователи старых версий смогли нормально смотреть эти комментарии.

С одной стороны, объединение обсуждений по темам постов в треды — это определенно удобно. С другой стороны, в публичных группах сейчас воцарился беспорядок: общение не по теме постов с канала смешалось с комментариями по типу "класс", "огонь", "я в истории"; антиспам-боты не справляются с комментаторами, не вступившими в группу; ответы, сделанные не через реплай, теряются.

Что ж, я думаю, революция Телеграм-чатов неизбежна. Возможно, именно поэтому BotAPI был подзаброшен, несмотря на стенания…