Ну ок. Но как минимум в 2016 году стоит писать универсально, чтобы на третьем питоне тоже работало. Чтобы потом сказать, что ничего переписывать не надо, переходим на современные технологии
Есть необходимость в инструментарии, который написан на втором поменять одну общую библиотеку, оставив неизменным её интерфейс (чтобы остальные компоненты не заметили подмены). Это пока основная причина в выборе второй версии.
Я однажды бенчмаркал так: делал один огромный массив на 4 гига и рандомно инкрементировал элементы. Bytearray выиграл и у array.array (несильно), и у numpy (в два раза)