VirtualBox, диски в его дефолтном формате, диски лежат файлами на ext4, ext4 на LUKS, LUKS на SSD, после fstrim брат не умирал.
dm-crypt имеет уязвимость при fstrim,но это думаю не критично, но сам fstrim, по крайней мере с qcow2 лучше делать внутри vm, а не с самим файлом.