Size: a a a

2021 April 05

LK

Lev Krasnov in Science FYI
Иван Котомин
Коллеги, а у кого есть доступ к базе JCR (webofknowledge.com)? Хочу попросить выгрузку всех входящих в WoS журналов с квартилями
Есть такая же база для Scopus)
источник

O

Orodret in Science FYI
Lev Krasnov
Есть такая же база для Scopus)
Кого сейчас скопус интересует?;)
источник

ER

Elkcis Remmah in Science FYI
Orodret
Кого сейчас скопус интересует?;)
А чем плох scopus? Функционал у его базы побольше, чем у WoS.
источник

O

Orodret in Science FYI
Elkcis Remmah
А чем плох scopus? Функционал у его базы побольше, чем у WoS.
Тем, что он не учитывается минобром))
источник

R

Ruz in Science FYI
Иван Котомин
Коллеги, а у кого есть доступ к базе JCR (webofknowledge.com)? Хочу попросить выгрузку всех входящих в WoS журналов с квартилями
а как это сделать? ручками то есть?
источник

ИК

Иван Котомин... in Science FYI
Orodret
Тем, что он не учитывается минобром))
+
источник

DP

Dmitry Penzar in Science FYI
Иван Котомин
Про математику в приложении к другим наукам могу по опыту сказать так: очень хорошо иметь одного математика на расширенную группу. Это, конечно же, и для статистики имеет значение (все встреченные мной учебники и курсы по матстату либо содержали ошибки, либо недостаточно подробно освещали вопросы применимости того или иного метода, что на конкретных данных рождало проблему; огромное количество опубликованных исследований содержит неверный анализ и тд).

Например, хорошо понимать и применять фристоновские модели в нейровизуализации без приличного уровня матана и линала довольно трудно. У нас в коллабе математик, вообще не имеющая специализации по нейре - единственная, кто обладает авторитетом уровня, условно, "перебивать завлаба". Причем все сугубо по делу.

Если хочется быть таким человеком - вполне можно оканчивать бак по математике, а там специализироваться в интересующую область :)
+
источник

ИК

Иван Котомин... in Science FYI
Ruz
а как это сделать? ручками то есть?
Угу. Но, вроде, это недолго, отметить просто все области, если я правильно помню
источник

ЛУ

Лена Убогоева... in Science FYI
Товарищи, здесь может кто проконсультировать по поводу кластеризации транскриптомов для метаанализа? А именно, корректно ли применять сначала MDS для понижения размерности, а затем на полученной матрице дистанций k-means для выделения кластеров? Я не нашла подобных статей с таким применением, а t-sne не очень для bulk рнасека подходит, насколько мне известно
источник

G

German in Science FYI
Лена Убогоева
Товарищи, здесь может кто проконсультировать по поводу кластеризации транскриптомов для метаанализа? А именно, корректно ли применять сначала MDS для понижения размерности, а затем на полученной матрице дистанций k-means для выделения кластеров? Я не нашла подобных статей с таким применением, а t-sne не очень для bulk рнасека подходит, насколько мне известно
Я бы не говорил "корректно", я бы сказал "можно"
источник

ЛУ

Лена Убогоева... in Science FYI
То есть все таки можно? Вопрос только в том, как это обосновать?
источник

ЛУ

Лена Убогоева... in Science FYI
Ну в смысле если объяснить, то все должно быть нормально
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Лена Убогоева
Товарищи, здесь может кто проконсультировать по поводу кластеризации транскриптомов для метаанализа? А именно, корректно ли применять сначала MDS для понижения размерности, а затем на полученной матрице дистанций k-means для выделения кластеров? Я не нашла подобных статей с таким применением, а t-sne не очень для bulk рнасека подходит, насколько мне известно
Норм
источник

ЛУ

Лена Убогоева... in Science FYI
спасибо!
источник

G

German in Science FYI
Лена Убогоева
То есть все таки можно? Вопрос только в том, как это обосновать?
Кластеризация и понижение размерности не математические строго определенные концепты, поэтому принцип такой - если картинка выглядит норм, то все норм
источник

DP

Dmitry Penzar in Science FYI
Лена Убогоева
Товарищи, здесь может кто проконсультировать по поводу кластеризации транскриптомов для метаанализа? А именно, корректно ли применять сначала MDS для понижения размерности, а затем на полученной матрице дистанций k-means для выделения кластеров? Я не нашла подобных статей с таким применением, а t-sne не очень для bulk рнасека подходит, насколько мне известно
tsne как раз нельзя кластеризовать. В нем расстояния с какого-то момента не значат ничего. MDS можно, он пытается сохранить все расстояния
источник

IV

Ivan Valiev in Science FYI
Лена Убогоева
Товарищи, здесь может кто проконсультировать по поводу кластеризации транскриптомов для метаанализа? А именно, корректно ли применять сначала MDS для понижения размерности, а затем на полученной матрице дистанций k-means для выделения кластеров? Я не нашла подобных статей с таким применением, а t-sne не очень для bulk рнасека подходит, насколько мне известно
Тебе в теории никто не мешает заделать кластаризацию хоть на результатах tSNE.
Проблема только в том, что это фига с два будет воспроизводиться.
Вектор ярлыков на tSNE ты можешь сохранить и потом юзать.
А вот классификатор фига с два - tSNE стохастический, координаты каждый раз будут разные.

MDS является детерминированным (емнип), так что там никаких проблем нет.
источник

DP

Dmitry Penzar in Science FYI
Ivan Valiev
Тебе в теории никто не мешает заделать кластаризацию хоть на результатах tSNE.
Проблема только в том, что это фига с два будет воспроизводиться.
Вектор ярлыков на tSNE ты можешь сохранить и потом юзать.
А вот классификатор фига с два - tSNE стохастический, координаты каждый раз будут разные.

MDS является детерминированным (емнип), так что там никаких проблем нет.
random seed?
источник

DP

Dmitry Penzar in Science FYI
проблема не в воспроизводимости, а в осмысленности. Если метод подразумевает, что ему на вход подаются нормальные расстояния, а ему на вход подается непойми что, то..
источник

IV

Ivan Valiev in Science FYI
Dmitry Penzar
random seed?
Все равно стремно
источник