Прикол в неизменяемой основе системы и атомарных обновлениях. Это не спин, это скорее другая технология установки тех же пакетов.
На всякий случай, "атомарный" в контексте какой-либо операции обозначает "неделимый", т.е. не имеющий промежуточных состояний. Операция либо выполнена, либо нет, и не может быть выполнена частично.