пакеты зависят друг от друга иногда через несколько ступеней, а потому возникает цикл зависимостей самым естественным путем, вот иногда некоторые зависимости можно отключить при помощи отключения и даже включения ЮЗ-флагов
Возвращаясь к пакету... Я понимаю, если там бы была какая-то куча пакетов под сборку. А так - всего два пакета нужно установить, и они не могут решить, кто от кого зависит. Явно чего-то не продумали, когда ebuild строили.