Что такое "много или мало опубликованные GPX"?
Если же речь идёт просто о коллекции GPX, которые надо сравнить с картой, то ничего удобнее сайта
nakarte.me я ещё не встречал. Треки добавляются на карту драг-н-дропом хоть десятками за раз. Щелчок по треку переносит тебя на место где он проходит. Удалить загруженные на просмотр треки можно так же - щелчком.