Любой программой, которая может писать файлы GPX, или другие с последующей конвертацией.
Я использую OsmAnd, там можно сразу добавлять точки, и тогда после загрузки на сайт, видно не только трек, но и прямо места отмеченные точками с моими текстовыми комментариями. Остаётся тыкнуть туда мышкой и поставить ноду, не надо выискивать глазами по спутнику.
Скажем, так удобно даже домики в деревне отмечать, потому что на снимке не разберёшь сходу где дом, а где сарай, а так когда идёшь мимо, то ставишь точку точно на дом.