У lxc контейнера будет тоже ядро что и на хосте и те-же модули. Причём не просто совпадение версии, а оно прям тоже самое)) потому что виртуализации и контейнеризацию это как бы разное)
Короче, USB Over IP - маст хэв. Это гораздо удобнее - держать все ключи в одном месте и подключать их потом куда угодно, не перетыкая при этом какие-то порты.
Ты про железки вот эти? Ну, не знаю. У нас проблем нет. Разные токены уже втыкали - проблем не было. У нас, правда нет такого говна, как 1С - поэтому конкретно про их ключи не знаю.