Емкостная связь, на сколько я понимаю имеет довольно малую длину распространения, но в пределах высоко точных приборов ее надо учитывать да вы правы, там нужно еще материал самой платы и толщину преплегов и ядер платы учитывать. Если этот эффект нужно убрать, то проще всего сделать четырех слойную плату сл слоями питания внутри.
Думать о всех линиях и их взаимодействии в простых устройствах, наверное излишне, так как перенося линии относительно прямых путей протекания тока мы так же создаем помехи и появляется замкнутый круг на двух слойной плате.
Я лично точные измерительные приборы не проектировал, но подозреваю, что это не так то просто)