Ничего не будет. Максимум попристает медсестра с просьбой принести. Вы в ответ спросите - на каком основании требует, в законе прописан исчерпывающий перечень документов для поступления в школу и медкарты там нет. У меня двое школьников без карт - одна в начальной сразу пошли без карты (в саду забрала, но в школу не отнесла), другая как раз как у вас ситуация - в одной школе забрала, в другую не отнесла. Спросили где карта - нету. Удивились и все. Будут прям очень сильно настаивать - просите официальное письмо с запросом. Могут еще давить на то, что без карты отстранят от физкультуры. Реагируйте спокойно - будет приказ директора об отстранении от урока с прописанным основанием, тогда будете решать вопрос просто со справкой о группе здоровья. Но оснований для такого приказа у директора нет.