ответили: "Насколько я понимаю, Вы получаете доход как фрилансер (физлицо) на бирже Upwork в иностранной валюте, после осуществляете перевод полученных денежных средств на расчетный счет ИП в рублях.
В этом случае назначение платежа при получении денежных средств на расчетный счет ИП в рублях (от продажи иностранной валюты) не влияет на обязанность плательщика НДС, поэтому, указанный текст в назначении платежа "НДС УПЛАЧИВАЕТСЯ ОТДЕЛЬНО" не несет для Вас никаких рисков и не требует дополнительных действий."