Вряд ли будет какая-то разница, с точки зрения накладных расходов самих библиотек. Но в квери можно наконфигурить какое-то адекватное поведение (инвалидацию кеша) просто, а вот с отдельными СМами придется кода намного больше писать, потому что они впринципе более общую задачу решают, а значит не имеют специфических оптимизаций.
Хотя, в экосистеме редакса недавно появился rtk-query