ну мне это кажется сомнительным бонусом. Все мне известные БД имеют известную процедуру миграции. Ты не можешь просто обновить постгрес на новую версию и быть уверенным что всё ок без проведения процедуры миграции. А если её проводить — то без разницы уже докер или не докер.
Причём, что смешно, миграцию тебе придётся проводить на остовой машине потому что файлы данных-то там )