Через Join - вероятно, нет, т.к. в процессе Join-а никаких Nll() и 0 быть не может, там только 1...
Либо через ApplyMap('map_НакладныеСЧеками', Накладая, 0), предварительно создав "map_НакладнаяСчеками", где будут уникальные накладные из чеков и 1...
Либо може еще как нибудь можно поменять ваш скрипт...
Надо смотреть по требованиям к производительности...