А я понял, о чем вы говорите.
Короче, особенности драйвера.
https://github.com/microsoft/WinAppDriver/blob/master/Samples/C%23/StickyNotesTest/ScenarioPen.csВот тут посмотрите.
var newStickyNoteWindowHandle = openedStickyNotes[0].GetAttribute("NativeWindowHandle");
newStickyNoteWindowHandle = (int.Parse(newStickyNoteWindowHandle)).ToString("x"); // Convert to Hex
DesiredCapabilities appCapabilities = new DesiredCapabilities();
Вот этот кусок кода гляньте, там указывается Hex код окна. И можно спокойно дальше продолжить автоматизировать.
Т.е. надо написать красивую логику, что если указана какая-нибудь опция, типо debug, то если нет запущенного приложения, то запустить его, а если есть запущенное приложение, в единственном экземпляре, то получить его код окна и прицепится к нему.