ВС

Если это время Transaction Controller со стандартными настройками (без учёта таймеров и без родительского запроса), то уменьшение длительности можно объяснить.
При настройках по умолчанию JMeter открывает соединение в начале каждой итерации и закрывает в конце.
Если добавить таймер, то итерация станет дольше. И значит RPS снизится. Значит снизится интенсивность создания новых соединений с сервером. И этим можно объяснить ускорение времени ожидания ответов.
Дело в том, что создать соединение - дорогая операция. А при высокой интенсивности (RPS) ненастроенная станция достигает лимитов по соединениям. И JMeter существенную часть времени ждёт соединения.
А при меньшем RPS, лимит достигается не так активно, соединения освобождаются. И меньше времени уходит на соединения.
Частично об этом доклад Ускоряем Apache.JMeter