Ну там скорее всего так: на каждой нажатие js что-то пытается делать и меняет фокус и/или положение курсора. Человек медленно печатает, оно работает. Скрипт быстро вводит и там js не успевает что-то довыполнить, как уже новый символ приходит.
Типа или по одному символу, и слип в 100 мс, или может даже группами - должно сработать.
Типа
$.sendKeys("BY")
sleep(100)
$.sendKeys("XYZ")
sleep(100)
И тд