Что-то не могу вдуплить как поменять настройки плагинов после запуска кода, аргумент можно изменить таким образом:

def pytest_configure(config):
    config.option.log_file = 'another_file.txt'

До плагинов можно достучаться так:

config.option.plugins

Получаю просто лист. При запуске с аргументом -p no:terminal - лист плагинов выглядит так: ['no:terminal']. Но модификация этого листа не даёт возможности включать или отключать плагины, которая мне очень нужна. На вопрос "зачем?" отвечу так: хочу одним аргументом включать/выключать ряд плагинов. Памагити =)

Там у пайтеста есть плагин менеджер

а что за CustomSession?
не совсем понял что мне нужно сделать после .unregister

config.pluginmanager.unregister(plugin='terminal')

не сработало, пробовал уже

после этого config.pluginmanager.getplugin("terminal") должен отдать None

значит вероятно не так все просто)

и вообще отключать терминал не лучша идея имхо