phpmetrics дает циферки на которые можно ориентироваться на уровне отдельных классов (lack of cohesion, afferent/efferent coupling). Есть еще вариант за каплингом следить через историю гита (code as crime scene можешь загуглить)
эти штуки сложно мерять так как штука относительная. Лучше всего по истории гита но это сложно. По кохижену можно ориентироваться на "рассояния изменений", по каплингу на частоту совместных изменений (когда пришлось править несколько файлов или фиксить баги)