iTunes 12.6 поставить , удалить не нужные мне приложения ,это издевательство ? А что тогда по вашему замена стандартных приложений ?
А обновление стандартное разве ничего не меняет? Если последовательно проводить обновления, то все хорошо устанавливается и работает, а если вы один из этапов пропустили и хаотично скачете от приложения к приложению, то проблем вам не миновать!