"Представьте что после каждого обновления - последовательного, 1С запускаем обработку удаления не нужных реквизитов или тех, которые поменялись на новые.
Например:
в обновлении №1 таких реквизитов 4
в обновлении №2 таких реквизитов 2
в обновлении №3 таких реквизитов 2
Когда Вы обновляете сразу на последнюю конфигурация вы удаляете только 2 реквизита. При этом 6 (4+2) других остаются в базе создавая и бардак и проблемы и ошибки.
Теперь ясно почем нельзя обновлять сразу на последний ?"