Имея старый винт, и новый винт побольше, я бы тупо склонировал полностью диск на новый, и потом раздел расширил на свободное место. После этого уже форматнул старый и сделал отдельным диском хранение файлов.
A junction (also called a soft link) differs from a hard link in that the storage objects it references are separate directories, and a junction can link directories located on different local volumes on the same computer. Otherwise, junctions operate identically to hard links. Junctions are implemented through reparse points.
Пользователей бы обматерил, и пинками и подзатыльниками заставил лишнее перенести из папок профиля ( с рабочего стола поебень всякую) на отдельный диск.