В общих чертах, двойное равно перед сравнением величин производит приведение типов; тройное равно сравнивает величины без приведения (если величины разных типов, вернет false, даже не сравнивая); ну и Object.is ведет себя так же, как и тройное равно, но со специальной обработкой для NaN, -0 и +0, возвращая false при сравнении  -0 и +0, и true для операции Object.is(NaN, NaN). (В то время как двойное или тройное равенство вернут false согласно стандарту IEEE 754.) Следует отметить, что все эти различия в сравнениях применимы лишь для примитивов. Для любых не примитивных объектов x и y, которые имеют одинаковые структуры, но представляют собой два отдельных объекта (переменные x и y не ссылаются на один и тот же объект), все операторы сравнения вернут false.