это как раз и понятно...проблема в понимании была в том что nginx везде описывается как процесс разруливающий всё. и всякие там nodejs вынуждены ему подчиняться(я это так понимал). Теперь понял что важно просто вперед всех стартануть nginx чтоб он был на коне)
вы можете без проблем стартануть сначала ноду, а потом нгинкс, просто в промежуток времени между запуском запросы на АпИ будут возвращать 502 Bad Gateway не будут работать