вообще говоря, есть библиотека
https://github.com/node-formidable/node-formidableУ которой есть возможность прокинуть обработчик, пока парсер будет по частям выдавать файл.
Ты в этот момент можешь пайпить в ffmpeg, а оттуда пайпить на нужный уже сервер. Единственное, я не знаю, может ли ffmpeg по частям принять файл.