Мне кажется в принципе путь обновления выбран костыльный. На 18-ую можно было обновиться, выбрав канал обновлений Beta. Если есть бэкап, возможно, проще всё вернуть и обновить без участия рук, чтоб nextcloud сам всё сделал как ему надо.
Ну или, если данных не много, вообще заново переустановить