apt и прочие системные менеджеры эту, хоть и выдуманную, проблему решают, pip не может. pil / pillow не сможет тебе в систему поставить libjpeg, pyarrow развалится от отсутствия glog, brotli и snappy, а pyspark для своей работы тащит 100 метров джарников просто потому что иначе никак не обеспечить работоспособность питонячего пакета. увы.
Да, pip не поставит libjpg для pillow. Но там где ты пропогандируешь одну строчку apt install, я напишу тоже одну строчку ansible-playbook :)