.net fx в контейнерах работает. но на win core просто нужно поставить его, если нет соответствующего образа, что врядли. правда, размер образа будет крайне высок
IIS Express конечно хорошо, но конфигурацию приложения в продакшене врядли так можно отладить. Если приложение работает у заказчика в контейнере, хочется и отлаживать его там. А потом в образе или с dockerfile поставить.