универсального совета нет. но обрати внимание, что таких проблем не возникает у народа с опытом. кроме чистки истории, которую надо делать не перед сохранением, а периодически, подчищать надо и лишние ноды, которые плодятся от комбайна или сепарейта мешей и т.д. чем больше будешь работать, тем меньше будешь жаловаться на майку