Основателями проекта являются Виктор Лавренко и Владимир Чернышов[5], которые познакомились на кафедре АСВК факультета вычислительной математики и кибернетики МГУ им М. В. Ломоносова в 2004 году.
В 2005 году на сервисе появилась функция кластеризации.
В 2007 году Владимир Чернышов отправился в Стэнфордский университет, где под руководством Эктора Гарсия-Молины разрабатывал алгоритмы для «Нигмы».