Да, ты прав. Так в чем стратегия тут заключается?)
Алгоритим следующий:
1. Устанавливаем живую систему на флешку чтобы с нее можно было гурзиться и работать с данными и прочими вещами.
2. Скачиваем и устанавливаем на нее установщик 10.11.
3. Сохраняем нужные данные на флешку или на другой внешний носитель.
4. Запускаем установщик 10.11 и устанавливаем уже на встроенный диск.
5. Переносим данные в 10.11 на встроенном диске.
6. Флешку оставляем как установочную/загрузочную для вот таких вот случаев. Данные на ней тоже можно переносить между маками.