Да много чем. Пакетным менеджером, набором софта в репах, удобством (или нет) установки софта отсуйствующего в репах. Дефолтными настройками системы. Набором дистроспецифичного софта (YaST в SUSE и mhwd в Manjaro, например). Опциями сборки программ, моделью обновления системы (релизные / роллинг / мягкий роллинг). Стабильностью. Наличием дров под всяку каку. Дефолтным сетевым менеджером. Возможностями кастомизации системы ещё на этапе установки. Некоторые даже инит системой, а некоторые, как NixOS или RancherOS, вообще ни на что не похожи... Продолжать?