Если новая таблица создана с нужными полями и одно из полей помечено как индекс (тут надо понимать о какой БД идет речь, скорей всего sqlite) то индексы будут генерироваться автоматом, можете просто их не переносить из старой таблицы. НО если у вас есть связи, то такой перенос должен быть сделан аккуратно, иначе получите ошибки