У винды есть системные api, через которые можно залочить файл от записи / чтения / удаления, но они, насколько я знаю, недоступны из ноды, так что или дергать через exec что-то, что умеет в такие вызовы, или менять права на файле. Но это, конечно, не совсем тот инструмент