Загрузочную флешку проще создать из под виндов программой BDU. Она создаст 2 раздела. Загрузочный будет виден и туда можно будет записать свой, готовый EFI.
не так давно я спрашивал как скрыть лишние приложения, которые мешают, ответ прост - создаем папку в удобном месте, кидаем в нее иконки нужных нам программ и выносим в док)