Ничем собственно. Просто разный софт, разные пакеты, разные стили. Как бы разная "философия". Все. По сути, одно и тоже с кучей вариацией, когда под капотом одно и тоже почти.
Взять тот же EOS. Вот на кой фиг они начали пилить новый ДЕ, а зачем взяли Vala, а на кой хрен они начали перепиливать Гном, всякие приложеньки, что уже есть... Хотя по сути тот же Гном, тот же Apt,...
BSD? Оно является гибридным ядром, в котором части ядра Mach сочетается с FreeBSD и C++ API.
Мы видать друг друга не поняли. Основная моя мысль в том, что все эти дистры действительно очень похожи друг на друга. Это происходит потому что все друг у друга (в основном у red hat) тащат.
Кстати. Вот к примеру вся разница между убунтой и zorin os заключается только в том, что в зорине из коробки установлено несколько расширений, нацеленных на внешний вид. Стоило ли ради нескучные обоев свой дистр пилить? Сомнительно.