А что может фатального произойти?

вы пошто людей стращаете попусту?

ну, оно может выстрелить сильно потом, когда придет пора обновляться =) от микса локальных и удаленных

А почему если скомпилировал из актуального дерева

ну так понятно что коли что-то было собрано с нестандартными опциями надо в дальнейшем апдейтить не из штатных пакетов, а из портов.

Ну если эти опции есть в порту

а головой подумать?

ну да, понятно, что геморра больше. надо смотреть каждый раз что откуда. но pkg ж пишет "options changed" так что отловить легко.

откуда в удаленном репозитории узнают, что локально чот там меняли в make config

нет там бред

так как у нас в пакете не реализованы дефолтные опции

А вы на пакетах или портах сидите и что легче поддерживать в актуальном состоянии долгое время

на стуле

Сарказм дело веселое

этот вопрос не сводится к двум противоположным ответам

вариантов заметно больше трех

проще использовать стандартные пакеты со стандартными опциями. следующий по простоте (а по времени наоборот) вариант если у вас свои опции собирать всё из портов или создать свой репозиторий с помощью poudriere (для одной машины я считаю это оверхед). далее микс - обновлять софт со стандартными опциями из пакетов, а с изменёнными - из портов. но тут можно ошибиться или попасть на рассинхрон какой-нибудь по версиям.

и какой утилитой управлять портами

make

в Handbook уже сходите. там всё очень доходчиво описано.