А отправляли как продажу? — если да, то скиньте покупателю файл с инвойсом от этого заказа — может, если показать его таможне с сопроводительным письмом, то выпустят так; если не выпустят, то нужно оплачивать повторно и дальше 2 варианта: поскольку это ваша вина, то во избежание плохих отзывов и ускорения — компенсировать этот двойной VAT клиенту; ну или, если вдруг клиент клевый и контактный, можно закинуть удочку, что он сам может от таможни получить возврат за переплату (собираются инвойс, квитанции о повторном начислении и оплате и, кажется, еще что-то — выше где-то была подробная инструкция на эту тему)) и это отправляется таможне, они делают возврат.